Institut NeuroMyoGène
    Laboratoire Physiopathologie et Génétique du Neurone et du Muscle
    CNRS UMR 5261 -INSERM U1315
    Université de Lyon - Université Claude Bernard Lyon 1
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ARCHITECTURE DU NOYAU ET DU CYTOSQUELETTE MUSCULAIRE

L’objectif global de notre équipe est de comprendre, dans le contexte de la différenciation et de la maturation musculaire (fibres musculaires squelettiques ou cellules cardiaques), les mécanismes de réarrangements des cytosquelettes contrôlant l’expression du génome et donc le destin des cellules musculaires. Ils se concentrent particulièrement sur le rôle de l’interactome du réseau de microtubules avec son lien sur (i) le positionnement & la forme du noyau dans les cellules musculaires et sur (ii) le contrôle de l’activité transcriptionnelle des noyaux musculaires. La fonction du tissu musculaire squelettique repose sur le maintien et la régénération des myofibres grâce à un processus finement régulé. Il commence par l’activation de cellules souches musculaires, dans lesquelles, le cil (structure microtubulaire) joue une rôle clef.

Une deuxième thématique de notre équipe vise à déchiffrer les implications des mutations nouvellement identifiées dans les gènes associés à l’architecture des noyaux ou à des composants du cytosquelette dans les maladies cardiaques (arythmie, cardiomyopathies hypertrophiques héréditaires (HCM) et cardiomyopathies dilatées (DCM)). Son équipe utilise des cultures de cardiomyocytes dérivés de cellules hiPS (directement de patients et/ou de cellules WT-hiPS où les mutations sont éditées à l’aide de la technologie CRISPR-Cas9) pour identifier l’implication fonctionnelle de mutations pathologiques putatives, en se concentrant sur les anomalies de contractilité, les troubles du cytosquelette et de la transcription.

Chromatine CNM Régulation épigénétique Lamine MAPs Microtubules  Cils Différentiation musculaire Domaines nucléaires Enveloppe nucléaire Sarcopénie Cellules souches
L’ÉQUIPE
  • Vincent GACHE
    CRCN INSERM, HDR
  • Caroline BRUN
    CRCN INSERM
  • Carole KRETZ-REMY
    PU UCBL1, HDR
  • Lea CASTELLANO
    PhD student (ED-BMIC-UCBL1)
  • Margot ROUCHETTE
    PhD student (AFM)
  • Marine DAURA
    PhD student (ANR)
  • Tanushri DARGAR
    PhD student (VetAgroSup)
  • Anna RAUSH DE TRAUBENBERG
    PhD student (ANR)
  • Cloé PARET
    PhD student (FRM)
  • Marion BOUVET
    Master 2
  • Emilie CHRISTIN
    AI UCBL1
  • Céline LOISEL
    IE Inserm
  • Marie ABITBOL
    PU VetAgroSup, HDR
  • Philippe CHEVALIER
    PU-PH UCBL, HDR
  • Alexandre JANIN
    DOCTORANT-AHU
  • Gilles MILLAT
    MCU-PH UCBL

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PROJETS

Évolution du protéome microtubulaire et son implication dans la formation et maintien des domaines nucléaires (MNDs) au cours du développement des muscles squelettiques (Leader: Dr. Vincent Gache)

Les noyaux se positionnent activement tout au long du développement musculaire. De nombreuses données supportent une connexion directe entre la régulation des domaines nucléaires, le maintien de l’architecture microtubulaire dans les fibres musculaires et le fonctionnement normal des muscles. Le réseau de microtubules est entièrement restructuré pendant la formation musculaire. Nous avons émis l’hypothèse que les différences entre le protéome associé aux microtubules dans les fibres immatures et matures contribuent à (1) la réorganisation des microtubules et (2) la localisation des noyaux. Nous avons développé une stratégie pour isoler et analyser ces deux protéomes en utilisant un système in vitro original qui permet la formation de fibres musculaires «matures» pures. Cette stratégie à conduit à la sélection de près de 500 candidats que nous étudions actuellement en utilisant une approche par criblage siRNA en utilisant des cellules musculaires murines/humaines primaires.

Déchiffrer les voies de signalisation régulées par le cil primaire dans les cellules souches musculaires (Leader: Dr. Caroline Brun)

La fonction du tissu musculaire squelettique repose sur le maintien et la régénération des myofibres grâce à un processus finement régulé. Il commence par l’activation de cellules souches musculaires (MuSCs) normalement quiescentes et se poursuit par la prolifération des MuSCs qui se différencient pour réparer les fibres lésées ou s’auto-renouvellent et retournent en quiescence pour restaurer leur stock. La perte de fonction des MuSCs entraîne inévitablement des troubles musculaires, tels que les maladies neuromusculaires, équivalant à une mauvaise qualité de vie, une perte d’indépendance et une augmentation de la morbidité/mortalité. Ainsi, une compréhension approfondie des processus biologiques fondamentaux régulant les MuSC garantira le succès des thérapies régénératives à base de cellules souches. Nous proposons différentes approches expérimentales visant à déchiffrer les voies de signalisation régulées par le cil primaire des MuSCs dans des contextes physiologiques et dystrophiques.

Modulation de l’intégrité des muscles squelettiques en contextes sain et pathologique (Leader: Dr. Carole Kretz-Remy)

Le fonctionnement de la fibre musculaire (myofibre) est soutenu par un positionnement précis de ses organites et noyaux. La force contractile des myofibrilles est contrôlée par le système de «couplage excitation-contraction» (ECC) de la triade, lieu de l’interconnexion entre le réticulum sarcoplasmique, un réseau de réticulum endoplasmique (RE) tubulaire, et les tubules transverses (-T), formés par des invaginations radiales répétées de la membrane plasmique. Les myopathies centronucléaires (CNM) sont des troubles neuromusculaires héréditaires dont la caractéristique majeure est une localisation anormale des noyaux au centre des myofibres. Nous cherchons à identifier des voies gouvernées par la protéine SH3KBP1 et participant au contrôle du RE, du RS, des tubules-T et de l’ECC, in vitro et in vivo.

Identification des mutations et leurs implications dans la physiopathologie des cardiomyopathies (Leader: Dr. Vincent Gache)

Les arythmies cardiaques sont des cardiomyopathies qui regroupent différents syndromes physiopathologiques tels que la fibrillation auriculaire, la tachycardie et la fibrillation ventriculaire. Le décryptage des mécanismes moléculaires impliqués dans ces cardiomyopathies permettra d’identifier des cibles thérapeutiques et de développer de nouveaux traitements. Nous menons une approche systématique qui consiste à identifier des mutations chez des patients atteints de cardiomyopathies. En utilisant des cellules iPS (cellules souches pluripotentes induites) et la technologie CRISPR/Cas9, nous développons des cardiomyocytes avec des mutations identifiées et déchiffrons l’implication in vitro des altérations génomiques sur le comportement de ces cellules.


SÉLECTION DE PUBLICATIONS

       1. Time shifting interferences for in depth tissue imaging in single molecule localization microscopy. Illand A, Jouchet P, Malleval C, Gache V, Monier K, Fort E, Lévêque-Fort S. Biophys J. 2023

  1. Immune-Mediated Rippling Muscle Disease Associated With Thymoma and Anti-MURC/Cavin-4 Autoantibodies. Svahn J, Coudert L, Streichenberger N, Kraut A, Gravier-Dumonceau-Mazelier A, Rotard L, Calemard-Michel L, Menassa R, Errazuriz-Cerda E, Chalabreysse L, Osseni A, Vial C, Jomir L, Tronc F, Le Duy D, Bernard E, Gache V, Couté Y, Jacquemond V, Schaeffer L, Leblanc P. Neurol Neuroimmunol Neuroinflamm. 2022.
  2. A PNPLA8 frameshift variant in Australian shepherd dogs with hereditary ataxia. Abitbol M, Jagannathan V, Laurent N, Noblet E, Dutil GF, Troupel T, de Dufaure de Citres C, Gache V, Blot S, Escriou C, Leeb T. Anim Genet. 2022.
  3. Simple Methods for Permanent or Transient Denervation in Mouse Sciatic Nerve Injury Models. Osseni A, Thomas JL, Ghasemizadeh A, Schaeffer L, Gache V*.. Bio Protoc. 2022.
  4. Golden cats: A never-ending story! Abitbol M, Dargar T, Gache V*. Anim Genet. 2022.
  5. Design and characterization of an in vivo injectable hydrogel with effervescently generated porosity for regenerative medicine applications. Griveau L, Lafont M, le Goff H, Drouglazet C, Robbiani B, Berthier A, Sigaudo-Roussel D, Latif N, Visage CL, Gache V, Debret R, Weiss P, Sohier J. Acta Biomater. 2022.
  6. MACF1 controls skeletal muscle function through the microtubule-dependent localization of extra-synaptic myonuclei and mitochondria biogenesis. Ghasemizadeh A, Christin E, Guiraud A, Couturier N, Abitbol M, Risson V, Girard E, Jagla C, Soler C, Laddada L, Sanchez C, Jaque-Fernandez FI, Jacquemond V, Thomas JL, Lanfranchi M, Courchet J, Gondin J, Schaeffer L, Gache V*. Elife. 2021.
  7. Deciphering DSC2 arrhythmogenic cardiomyopathy electrical instability: From ion channels to ECG and tailored drug therapy. Moreau A, Reisqs JB, Delanoe-Ayari H, Pierre M, Janin A, Deliniere A, Bessière F, Meli AC, Charrabi A, Lafont E, Valla C, Bauer D, Morel E, Gache V, Millat G, Nissan X, Faucherre A, Jopling C, Richard S, Mejat A, Chevalier P. Clin Transl Med. 2021.
  8. Siberian cats help in solving part of the mystery surrounding golden cats. Beauvois H, Dufaure de Citres C, Gache V, Abitbol M. Anim Genet. 2021
  9. SH3KBP1 scaffolds endoplasmic reticulum and controls skeletal myofibers architecture and integrity. Guiraud A, Christin E, Couturier N, Kretz-Remy C, Janin A, Ghasemizadeh A, Durieux AC, Arnould D, Romero NB, Bui MT, Buchman VL, Julien L, Bitoun M, Gache V*. BioXriv. 2020.
  10. HDAC6 regulates microtubule stability and clustering of AChRs at neuromuscular junctions. Osseni A, Ravel-Chapuis A, Thomas JL, Gache V, Schaeffer L, Jasmin BJ.J Cell Biol. 2020.
  11. Genetic heterogeneity of polydactyly in Maine Coon cats. Hamelin A, Conchou F, Fusellier M, Duchenij B, Vieira I, Filhol E, Dufaure de Citres C, Tiret L, Gache V, Abitbol M. J Feline Med Surg. 2020.
  12. SMAD6 overexpression leads to accelerated myogenic differentiation of LMNA mutated cells. Janin A, Bauer D, Ratti F, Valla C, Bertrand A, Christin E, Chopin E, Streichenberger N, Bonne G, Gache V, Cohen T, Méjat A. Sci Rep. 2018.
  13. Nesprins and Lamins in Health and Diseases of Cardiac and Skeletal Muscles. Janin A, Gache V*. Front Physiol. 2018
  14. Microtubule motors involved in nuclear movement during skeletal muscle formation. Gache V*, Gomes ER, Cadot. MBoC. 2017

FUNDING
  • AFM-MyoNeurALP-2 program (2022-2027): Myonuclear domains establishment and maintenance during muscle development.
  • ANR-JCJC Grant 2022 (STEMCIL) (Leader: Dr. Brun)
  • RHU Grant (SMART) 2021 (Leader: Dr. Gache)
  • ANR Grant (Atrorescue) (Leader: Dr. Kretz))
  • INMG-CNMD Joint Collaborative Research Program (2020): Spatial transcriptomic identity of myonuclei in myopathies. Collaborator: Prof. Theodore J. Perkins, Ottawa
  • INMG-CNMD Joint Collaborative Research Program (2020): Implication of formins during skeletal muscle formation. Collaborator: Dr. John Copeland, Ottawa
  • AFM-MyoNeurALP-1 program (2018-2022): Myonuclear domains establishment and maintenance during muscle development.
  • ATIP Avenir program (2015-2020): Interplay between cytoskeleton network regulation during muscle development and muscle function.
  • Centre de references maladies rares (Cardiologie, Pr. Philipe Chevalier)
  • ANR: Identification of injectable and haemostatic hydrogel for guiding and reconstruction of deep wounds
  • ALMS: Mutations identification and implication in the physiopathology of cardiomyopathies

 

Email

vincent.gache@univ-lyon1.fr

Téléphone

+33 4 78 77 75 51

ORCID

0000-0002-2928-791X

Addresse

Institut NeuroMyogène (INMG-PGNM)
Pathophysiology and genetics of neuron and muscle (PGNM)
MNCA Team (Muscle Nuclear & Cytoskeleton Architecture)
CNRS/UCBL1 UMR 5261 – INSERM U1315
8 avenue Rockefeller/ 1 rue Charles Jung (Livraison)
F-69373 Lyon-cedex 8
France


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